Das Refektorium aus der Zeit um 1480 gehört zu den schönsten gotischen Räumen an der deutschen Ostseeküste. Es beherbergt die Sammlung mittelalterlicher Kunstwerke aus Rostocker Klöstern sowie einen Teil des kostbaren Schatzes des Klosters zum Heiligen Kreuz. Die um 1360 fertig gestellte Klosterkirche (Universitätskirche) war von der Gründung des Konventes bis zu seinem Ende im 20. Jahrhundert das Zentrum der im Kloster lebenden Gemeinschaft. Beide Räume gibt es dann auch wieder live bei uns im Museum zu erleben.